Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP1BQ7LBR1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP1BQ7LBR1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP1BQ7LBR1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP1BQ7LBR1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms