Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY3Q7L099 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUFY3Q7L099 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms