Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY3Q70JA7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY3Q70JA7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms