Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP34Q70CQ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP34Q70CQ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP34Q70CQ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms