Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM43BQ6ZT52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM43BQ6ZT52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms