Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSZ5

ARHGEF18, Rho guanine nucleotide exchange factor 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF18Q6ZSZ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF18Q6ZSZ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF18Q6ZSZ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF18Q6ZSZ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF18Q6ZSZ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF18Q6ZSZ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF18Q6ZSZ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF18Q6ZSZ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms