Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL4Q6ZR62 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL4Q6ZR62 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL4Q6ZR62 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms