Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM72Q6ZMU5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM72Q6ZMU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM72Q6ZMU5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms