Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN4Q6ZMN7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.6 ms