Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00114Q6XXX2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00114Q6XXX2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00114Q6XXX2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms