Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP26C1Q6V0L0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYP26C1Q6V0L0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYP26C1Q6V0L0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYP26C1Q6V0L0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms