Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMBR1LQ6UX01 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMBR1LQ6UX01 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMBR1LQ6UX01 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMBR1LQ6UX01 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms