Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMCO3Q6UWJ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TMCO3Q6UWJ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO3Q6UWJ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
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