Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTA2Q6UW10 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTA2Q6UW10 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTA2Q6UW10 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTA2Q6UW10 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SFTA2Q6UW10 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms