Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BLOC1S2Q6QNY1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BLOC1S2Q6QNY1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BLOC1S2Q6QNY1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BLOC1S2Q6QNY1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms