Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BLOC1S3Q6QNY0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BLOC1S3Q6QNY0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BLOC1S3Q6QNY0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms