Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF613Q6PF04 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF613Q6PF04 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms