Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEPROQ6NW34 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEPROQ6NW34 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEPROQ6NW34 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms