Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMYD5Q6GMV2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMYD5Q6GMV2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD5Q6GMV2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD5Q6GMV2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD5Q6GMV2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD5Q6GMV2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD5Q6GMV2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD5Q6GMV2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms