Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TXNDC8Q6A555 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TXNDC8Q6A555 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TXNDC8Q6A555 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TXNDC8Q6A555 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms