Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF43Q68DV7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF43Q68DV7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF43Q68DV7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF43Q68DV7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF43Q68DV7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF43Q68DV7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF43Q68DV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF43Q68DV7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF43Q68DV7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF43Q68DV7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms