Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP1BQ659C4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1BQ659C4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1BQ659C4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LARP1BQ659C4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms