Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATRNL1Q5VV63 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATRNL1Q5VV63 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATRNL1Q5VV63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms