Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RPRD2Q5VT52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
RPRD2Q5VT52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
RPRD2Q5VT52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms