Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC1Q5TB30 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DEPDC1Q5TB30 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms