Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA50

CPTP, Ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTPQ5TA50 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPTPQ5TA50 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPTPQ5TA50 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPTPQ5TA50 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPTPQ5TA50 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPTPQ5TA50 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms