Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
L1TD1Q5T7N2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
L1TD1Q5T7N2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
L1TD1Q5T7N2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms