Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM61Q5EBN2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM61Q5EBN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM61Q5EBN2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms