Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIN4Q56A73 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIN4Q56A73 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIN4Q56A73 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms