Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB6CQ53S08 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB6CQ53S08 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB6CQ53S08 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms