Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNDC1Q4ZHG4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FNDC1Q4ZHG4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNDC1Q4ZHG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNDC1Q4ZHG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms