Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01620Q4KN68 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01620Q4KN68 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01620Q4KN68 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms