Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN20Q4JDL3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN20Q4JDL3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN20Q4JDL3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN20Q4JDL3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN20Q4JDL3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms