Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT71Q3SY84 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT71Q3SY84 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT71Q3SY84 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms