Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD55Q3KP44 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD55Q3KP44 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms