Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF6Q330K2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDUFAF6Q330K2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFAF6Q330K2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms