Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TYSND1Q2T9J0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TYSND1Q2T9J0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TYSND1Q2T9J0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TYSND1Q2T9J0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYSND1Q2T9J0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TYSND1Q2T9J0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms