Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6LQ2NKX8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms