Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCB5Q2M3G0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCB5Q2M3G0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCB5Q2M3G0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms