Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF2Q1L5Z9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF2Q1L5Z9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF2Q1L5Z9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF2Q1L5Z9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms