Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
COL24A1Q17RW2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
COL24A1Q17RW2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
COL24A1Q17RW2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms