Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN21Q16825 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN21Q16825 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
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