Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM1Q16610 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM1Q16610 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ECM1Q16610 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM1Q16610 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
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