Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIK5Q16478 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIK5Q16478 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GRIK5Q16478 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIK5Q16478 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms