Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSX1Q16384 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX1Q16384 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX1Q16384 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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