Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms