Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAM1Q15629 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAM1Q15629 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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TRAM1Q15629 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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