Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A2Q15428 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SF3A2Q15428 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms