Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR6A1Q15406 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR6A1Q15406 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR6A1Q15406 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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