Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK3Q15120 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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